Dengan di tetapkannya SMK Negeri 5 Jember, sebagai SMK pusat keunggulan atau Center of Excellence (CoE) oleh Kemendikbud melalui Direktorat Sekolah Menengah Kejuruan dalam bidang Agriteknologi Pengolahan Hasil Pertanian, menjadi kebanggaan khususnya bagi warga SMK Negeri 5 Jember.
Pasalnya, program Pengembangan Pusat Keunggulan ( Center Of Exellence / CoE), merupakan implementasi Instruksi Presiden Nomor 9 Tahun 2016 tentang Revitalisasi Sekolah Menengah Kejuruan untuk meningkatkan kualitas Sumber Daya Manusia Indonesia, yang mana salah satu amanatnya adalah perlunya revitalisasi SMK secara komperhensif untuk menghasilkan lulusan SMK yang berdaya saing dan siap menghadapi tantangan dan dinamika perkembangan nasional maupun global.
Center Of Excellence (COE) prioritas sektor Agriteknologi Pengolahan Hasil Pertanian merupakan program pengembangan pusat keunggulan bagi SMK yang bertujuan untuk meningkatkan mutu pendidikan SMK. SMK Negeri 5 Jember khususnya kompetensi keahlian Agriteknologi Pengolahan Hasil Pertanian adalah salah satu sekolah yang menerima program bantuan tersebut.